Viene rivelato che durante uno scontro con l'undicenne Ben Tennyson, Malware ha toccato il simbolo dell'Omnitrix su 2x2. Dopo la battaglia, andò dal dottor Psycho e gli fece creare un prototipo di Omnitrix, il Nemetrix. Nel presente, dopo un'accesa discussione, Ben e Rook si separano, dando a Khyber la migliore possibilità di catturare Ben.
