Zia Polly e il padre di Ben cercano inutilmente i ragazzi, che si stanno invece divertendo sull'isola. Arriva un grande temporale, il fiume si ingrossa, la zattera rompe gli ormeggi e i ragazzi si ritrovano quindi bloccati sull'isoletta: anche se "i pirati" non devono far vedere di avere paura, Tom la sera comincia ad avere nostalgia di Becky. La zattera viene ritrovata dal padre di Ben semidistrutta sugli scogli e nel villaggio ormai si pensa al peggio.