Alors que le Capitaine Gantt pousse son sous-marin nucléaire à la vitesse dangereuse de 75 noeuds afin de tester un nouveau carburant surpuissant qu'il a développé, son officier exécutant, Balter, le prévient que la coque risque exploser. Soudain, une toile géante apparaît devant eux, et le sous-marin s'enfonce dedans. Avant que Gantt et d'autres survivants soient sauvés, à l'exception de Balter, Gantt aperçoit une créature géante ressemblant à une araignée qui surgit des profondeurs. Lorsque la marine débute son enquête, Nelson et le Neptune doivent retrouver les restes des quatre cylindres de carburant dans le sous-marin de Gantt...