ในช่วงเปลี่ยนศตวรรษ เหล่าทูตสวรรค์กลับมายังโลกเพื่อพยายามล้างมนุษยชาติด้วยความโกรธแค้นที่สิ้นโลก ซากศพสุดท้ายของมนุษยชาติต้องตกตะลึงเพื่อรอวันที่เหล่าทูตสวรรค์จะกลับมาทำงานให้เสร็จ สิบห้าปีต่อมา วันนั้นก็มาถึง... แต่คราวนี้ มนุษยชาติพร้อมที่จะต่อสู้กลับด้วยอาวุธกลไกชีวภาพที่น่าสะพรึงกลัวที่รู้จักกันในชื่อ Evangelions ดู Shinji, Rei, Asuka และหน่วยงานเงาลึกลับที่เหลือ Nerv ต่อสู้เพื่อกอบกู้โลกจากการถูกทำลายล้างทั้งหมด
