Lucy face parte dintr-o rasă specială de oameni numită „Diclonius”, născută cu o pereche scurtă de coarne și mâini telekinetice invizibile, care o fac o victimă a experimentelor științifice inumane a guvernului. Totuși, odată ce împrejurările îi dau o oportunitate de a scăpa, Lucy, sătulă de detenție și de tortură, dezlănțuie o mare de vărsare de sânge pe măsură ce scapă de captorii ei. În timpul evadării, ea se rănește la cap, rană care o lasă cu o personalitate divizată: cineva cu mentalitatea unui copil inofensiv care posedă o capacitate limitată de vorbire. În timpul acestei stari de instabilitate, ea dă peste doi elevi, Kouta și verișoara lui Yuka, care, în mod neașteptat, iau un fugar rănit în îngrijirea lor, fără să știe despre inclinațiile ei criminale. Acest act de bunătate le va schimba viața, deoarece în curând se vor trezi în lumea sumbră a secretelor guvernamentale și a conspirațiilor.
