W trzeciej części pojawiają się dwie nowe czarodziejki Sailor Uranus i Sailor Neptune. Poszukują posiadaczy trzech talizmanów, które są zaklęte w kryształach czystych, ludzkich serc. Główni przeciwnicy drużyny Czarodziejek – Bractwo Śmierci, także poszukuje talizmanów, aby przebudzić Mesjasza Ciszy, który będzie zdolny sprowadzić na Ziemię mistrza Pharaoh 90. Po zdobyciu trzech kryształów i stworzeniu Świętego Graala (któremu towarzyszyła nowa przemiana Sailor Moon), nowe czarodziejki postanowiły odszukać Mesjasza, który będzie zdolny zapobiec planom Bractwa Śmierci.
