Tijdens het onderzoeken van een dodelijk ongeval op een marinebasis ontdekt de NCIS dat een eenheid Seabees (de genietroepen van de US Navy) vergiftigd was met een besmettelijk supervirus waardoor de rest van de basis en de hele stad New Orleans gevaar lopen voor een catastrofale uitbraak. Tijdens de autopsie is dokter Wade ook geïnfecteerd met het virus en heeft nog maar enkele uren te leven als er geen tegengif kan worden gevonden.