Sono passati dei mesi da quando Kagari è sparita nel nulla. Okabe e gli altri l’hanno cercata in tutti i luoghi possibili e immaginabili, ma non sono riusciti a trovare alcun indizio. Nel frattempo, Daru e Suzuha stanno cercando di convincere Maho a collaborare alla creazione di un’altra macchina del tempo, poiché la precedente è stata distrutta da Okabe.