Un mondo in cui esseri misteriosi chiamati "Disastri" minacciano continuamente la pace del mondo. Un'unità militare speciale chiamata Saber viene formata per opporsi al Disastro. Anche i conglomerati privati e l'organizzazione indipendente di autodifesa Blade si formano e avanzano verso il nemico. Noii è uno studente delle superiori che desidera unirsi a Sabre e combattere il disastro. Dopo che una misteriosa ragazza di nome Motis si è trasferita nella sua classe, la sua vita normale cambia completamente.