In der zweiten Staffel stellt sich die Besatzung der U.S.S. Enterprise unter dem Kommando von Captain Christopher Pike immer gefährlicheren Aufgaben, erkundet unbekannte Gebiete und trifft auf neues Leben und neue Zivilisationen. Die Besatzung wird sich auch auf persönliche Reisen begeben, die ihre Entschlossenheit auf die Probe stellen und ihr Schicksal neu definieren werden. Sie treffen auf neue und bekannte Freunde und Feinde, und ihre Abenteuer werden sich auf überraschende Weise entwickeln, wie sie es noch nie zuvor gesehen haben.
