I en ikke så fjern fremtid har opfindelsen The Great Machine fået alle jordens maskiner til at gøre oprør mod menneskene, hvilket fører til, at hele jordens befolkning bliver udslettet. Men mens vores verden går til grunde, begynder en mission, der skal redde civilisationen. En videnskabsmand skaber 9 forskellige væsner og giver dem liv i de sidste dage af menneskeheden, så de kan leve videre efter apokalypsen. De 9 har hver deres unikke egenskaber og job at udføre, men #9 har nogle særlige evner og kommer til at spille en vigtig rolle i kampen for at bevare en civilisation...
